El Consejo Científico del ERC, integrado por 22 distinguidos científicos y académicos representantes de la comunidad científica europea, es el órgano rector del Consejo Europeo de Investigación. Está presidido por el Presidente del ERC, el Profesor Jean-Pierre Bourguignon y cuenta con tres Vicepresidentes, de los cuales el actual Vicepresidente Klaus Bock continuará su mandato. El papel principal del Consejo Científico es el establecimiento de la estrategia del ERC y la selección de los evaluadores de revisión por pares.
Estos nuevos miembros han sido seleccionados por un Comité de Expertos compuesto por siete distinguidos científicos designados por la Comisión Europea. La comunidad científica fue consultada en este proceso.